Con la eliminación de los equipos grandes, América y Rayados, se dio pase al primer cruce de Semifinales de la Liguilla del Apertura 2021.
Pumas, el peor clasificado, eliminó a los líderes Águilas; mientras que el Atlas, segundo mejor equipo de la Fase Regular, eliminó al Monterrey.
Así que ahora los Rojinegros son el mejor equipo clasificado, por lo que van contra el equipo universitario.
De haber persistido el gol de visitante como primer criterio de desempate en el marcador global, el Monterrey continuaría en la Liguilla, ya que en el primer partido el marcador terminó 0-0.
Por cierto, al Atlas no le ha ido nada bien enfrentando al equipo de la UNAM en Liguillas. Se han enfrentado en un par de cruces, en ambos avanzaron los capitalinos, ganaron los cuatro partidos y además terminaron siendo campeones: Clausura 2004 y Apertura 2004.